Shirika la Elimu Kibaha lina Vitengo 7 na Kurugenzi 5 kama ifuatavyo:-

• 1.Kitengo cha Ukaguzi wa Ndani
• 2.Kitengo cha Mali na Ujenzi
• 3.Kitengo cha Mipango, Ufuatiliaji na Tathmini
• 4.Kitengo cha Uhusiano, Mawasiliano na Masoko
• 5.Kitengo cha Ununuzi na Usimamizi wa Vifaa
• 6.Kitengo cha Huduma za Sheria
• 7.Kitengo cha Teknolojia ya Habari na Mawasiliano
• 8.Kurugenzi ya Huduma za Afya
• 9.Kurugenzi ya Maendeleo ya Jamii, Mafunzo, Utafiti na Uzalishaji
• 10.Kurugenzi ya huduma za Elimu
• 11.Kurugenzi ya Utawala na Usimamizi wa Rasilimali watu
• 12.Kurugenzi ya Fedha na Hesabu